Der VSA ist ein Verein im Sinne von Artikel 60 ff. des ZGB. Sein oberstes Organ ist die Mitgliederversammlung, in welcher jedes Mitglied eine Stimme hat.

Mitglieder des VSA sind Einzelpersonen, öffentliche Verwaltungen, Zweckverbände, Ingenieurbüros, Firmen, Schulen und Institute, die durch ihre Tätigkeit am Gewässerschutz oder an der Abwassertechnik interessiert sind.

Die 5 CC sind verantwortlich für den Inhalt der Publikationen, Veranstaltungen und Ausbildungsgänge. Sie bestehen aus jeweils 15 bis 40 ehrenamtlich tätigen Verbandsmitgliedern.

Der Vorstand ist für die strategische Ausrichtung des Verbandes zuständig. Der Geschäftsführer leitet den VSA operativ und betreut die Arbeit der CC. Unterstützt wird er dabei von den sechs ständigen Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern der Geschäftsstelle.